4D蛋白组学:tims TOF Pro2依赖于双捕集离子淌度(TIMS)和同步累积连续碎裂(PASEF)数据采集模式两大创新技术,可实现快速采集、更高的灵敏度和特异性。同时,其配备了***一代双 TIMS 分析器,离子容量可提高三倍,比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,让蛋白质组学分析再上一个新的台阶,鹿明生物同时配备了Evosep One高通量色谱使其在短梯度下也能实现蛋白深度覆盖,结果更精细,也成为转化组学应用不可或缺的工具。更高扫描速度:助力临床大队列项目研究,更高覆盖深度:助力蛋白组鉴定到更多的蛋白数量,超高灵敏度:助力微量样本蛋白组分析,鉴定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鉴...
蛋白组学研究实用案例:东南大学医学院院长刘必成教授领导的肾脏病研究所在Science advances期刊发表了题为“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果,通过蛋白组学+多层组学研究方法,建立IL-10细胞囊泡高表达模型的构建,提出并验证了IL-10细胞外囊泡的靶向缺血性肾损伤的假说,探究了IL-10细胞外囊泡作为新型纳米药物的机理。中文标题:细胞外囊泡包裹的IL-10作为抗缺血性急性肾损伤的新型纳米疗法研究方向:新药研发及其机制研究发表期刊:S...
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法:2021年7月,海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技...
综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。蛋白组学—精选文章推荐。浙江芯片蛋白组学本文为了探究其潜在的分子机制,作者运用RNA测序(RNA-seq)和iTR...
为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域,使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织,为每个队列生成蛋白质共表达网络,并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域(图2b)。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发,建立蛋白共表达网络,综合转录组学结果,解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物,并为治疗带来希望。4D-蛋白组+代谢组双平台知识干货带您。辽宁磷酸化蛋白组学北京随着美国临床蛋白质组**分析项目(CPTAC)和中国人类蛋...
通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs,在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外,热图分析揭示了不同表达的功能基因,包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明,HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关,增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力,因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述,结果证...
单细胞蛋白组学研究方法:2020年9月,加州大学的MinnieM.Sarwal课题组在FrontiersinMedicine发表的题为“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通过单细胞蛋白组学研究方法,分析正常人近端肾小管和肾小球区域的肾脏细胞,研究为解开急性和慢性肾脏疾病病因和肾脏亚细胞功能扰动提供依据。中文标题:正常人肾脏近端肾小管和肾小球的单细胞蛋白质组学分析研究对象:人体肾脏组织发表期刊:FrontiersinMedicine影响因...
TMT标记定量蛋白组学研究案例:2021年11月,南京中医药大学附属医院江苏省中医院单位(一作刘史佳研究员)及其课题组在MolecularMetabolism期刊发表的题为“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通过TMT标记定量蛋白组学和GC-MS非靶代谢组学研究方法,发现了糖尿病肾病(DKD)特征,筛选了蛋白和代谢容组合生物标志物。为优化糖尿病肾病(DKD)管理提供了丰富且开放访问的数据资源。中文标题:血清综合组学揭示人类糖尿病肾病情况研究对象:人血清发表期刊:Molecular...
使用TMT标记定量蛋白质组学分析,与GFP-群体相比,在GFP+细胞中TM处理后,线粒体复合物IV的多个亚基被特异性下调,对下调的蛋白质进行基因本体 (GO)分析,显示参与线粒体电子传递链 (ETC) 的通路富集。同时作者还分析了从人 LM2 细胞系中分选的 LM2 GFP+和 GFP- 细胞,在 TM 处理 48 小时后蛋白组学分析,揭示了GFP+细胞优先富集,同时揭示了线粒体 ETC 相关的通路。因此,TM 处理特别影响具有更高细胞内铜水平的 SOX2/OCT4+ 细胞中的线粒体 ETC 通路。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒...
为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域,使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织,为每个队列生成蛋白质共表达网络,并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域(图2b)。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发,建立蛋白共表达网络,综合转录组学结果,解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物,并为治疗带来希望。单细胞蛋白质组学,极微量样本检测。上海itraq定量蛋白组学价格单细胞蛋白组学研究方法:2020年9月,加州大学的Min...
通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs,在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外,热图分析揭示了不同表达的功能基因,包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明,HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关,增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力,因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述,结果证...
通过蛋白质组学质谱鉴定、PRM靶向鉴定、iTRAQ标记定量蛋白组学等研究方法,发现了N-豆蔻酰化在肝脏**发生中发挥重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**发生的NDP,并通过干扰泛素化来刺激促**发生的NUP机制。为靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理论依据。中文标题:NMT1依赖于POTEE发生N-豆蔻酰化并通过差异调节靶标的泛素化来刺激肝脏**的发生研究对象:细胞、小鼠、人**组织发表期刊:FrontiersinOncology影响因子:6.244发表时间:2021年5月合作单位:上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心运用生物技术:iTRAQ标记定量蛋白组学、P...
通过蛋白质组学+转录组学研究方法,发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征,探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用,为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题:大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象:大鼠血浆外泌体发表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子:11.413发表时间:2021年10月合作单位:四川大学华西医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、转录组学蛋白组学—精...
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。扎根蛋白组学临床科研基础研究领域,多年项目服务经验...
本研究采用串联质量标签(TMT)标记的蛋白质组学和平行反应监测(PRM)技术,对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明,碳水化合物代谢(包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织)、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中,非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂,在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明,H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的见解。蛋白质组学多组...