作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。扎根蛋白组学临床科研基础研究领域,多年项目服务经验。内蒙古糖基化蛋白组学
综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。内蒙古糖基化蛋白组学欧易鹿明生物基于质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学。
本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在ScienceoftheTotalEnvironment期刊发表了的文章,通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌***加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响,因此本研究结果具有重要的指导意义。在本研究中,研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水(约2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌进行***处理,以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌***的免疫反应。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法,对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究,以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。
为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域,使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织,为每个队列生成蛋白质共表达网络,并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域(图2b)。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发,建立蛋白共表达网络,综合转录组学结果,解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物,并为治疗带来希望。靶向蛋白质组学,信号通路蛋白靶点高通量分析。
蛋白组学技术可以提供细胞状态和调控的功能信息,本研究建立了单细胞蛋白组学方法,实现了高灵敏度的蛋白组学检测。该技术有助于揭示疾病的发病机制,探讨预后和风险相关的不同肾脏疾病亚型中的蛋白组学异质性和独特的蛋白标志物,为药物靶点***提供希望。大规模单细胞分析对于捕获复杂细胞系统中的生物异质性至关重要,但*基于RNA技术的单细胞转录组学数据并不能很好地**蛋白质水平上的变化。而单细胞蛋白组学技术能够从蛋白质水平上破译细胞机制并且获得更多的信息。蛋白组学近期研究进展的盘点。内蒙古糖基化蛋白组学
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4D蛋白组学:tims TOF Pro2依赖于双捕集离子淌度(TIMS)和同步累积连续碎裂(PASEF)数据采集模式两大创新技术,可实现快速采集、更高的灵敏度和特异性。同时,其配备了***一代双 TIMS 分析器,离子容量可提高三倍,比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,让蛋白质组学分析再上一个新的台阶,鹿明生物同时配备了Evosep One高通量色谱使其在短梯度下也能实现蛋白深度覆盖,结果更精细,也成为转化组学应用不可或缺的工具。更高扫描速度:助力临床大队列项目研究,更高覆盖深度:助力蛋白组鉴定到更多的蛋白数量,超高灵敏度:助力微量样本蛋白组分析,鉴定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鉴定。内蒙古糖基化蛋白组学
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